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L'une des caractéristiques les plus remarquables de la biodiversité des Canaries est son endémisme élevé. De nombreuses espèces de plantes et d'animaux ne se trouvent nulle part ailleurs. Cela est en grande partie dû à l'isolement géographique de l'archipel, qui a permis à de nombreuses espèces de se développer et de s'adapter de manière unique aux conditions locales.
Le climat des Canaries, caractérisé par des températures douces toute l'année et des précipitations variables d'une île à l'autre, a favorisé une grande diversité de paysages et d'écosystèmes. On trouve des forêts subtropicales, des zones désertiques, des zones humides et des écosystèmes côtiers, chacun abritant sa propre faune et flore spécifiques. Par exemple, la laurisilva, une forêt subtropicale de lauriers, dense et luxuriante, est caractéristique et emblématique des îles Canaries. On la retrouve notamment sur les îles de Tenerife, La Palma et La Gomera.
Au détour des chemins, il est commun de voir des dragonniers des Canaries, des pins canariens, des palmiers et des cactus. Plus rares, certaines plantes telles que le tabaiba dulce (Euphorbia balsamifera), la tabaiba amarga (Euphorbia obtusifolia), le Sonchus acaulis et le marguerite des Canaries (Argyranthemum frutescens) sont endémiques et se trouvent uniquement aux Canaries.
Au détour des chemins, il n'est pas rare de croiser le Gallotia, le lézard géant des Canaries, aux couleurs vives.
Les îles sont également le point de passage de nombreux oiseaux migrateurs et il est possible d'y observer le faucon crécerellette, le pétrel de Bulwer ou encore le cormoran huppé. Les fonds marins, notamment ceux d'El Hierro, sont prisés des amateurs de plongée, qui explorent récifs coralliens et grottes sous-marines afin d'y observer poissons tropicaux, tortues, dauphins et baleines.