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La Grèce se distingue par la protection de la nature et de sa biodiversité. Le pays compte neuf parcs nationaux et dix réserves aquatiques, ainsi qu'un réseau Natura 2000 qui couvre 27,1 % du territoire grec. Parmi les 900 espèces animales présentes en Grèce, 200 sont protégées, de même que 800 espèces végétales sur 4050 espèces sauvages. Les maquis méditerranéens couvrent de vastes étendues, caractérisées par des arbustes tels que le laurier-rose, le thym, et l'olivier. Les forêts de chênes, de pins et de hêtres recouvrent les montagnes, abritant une diversité d'espèces, dont le lynx ibérique et le loup gris. Les zones humides, comme le delta de l'Axios, sont le refuge de nombreuses espèces d'oiseaux migrateurs, y compris le pélican frisé et le flamant rose. La région du lac Kerkini accueille la grue cendrée et l'aigle impérial alors que les montagnes sont le domaine du gypaète barbu, un majestueux vautour. La Grèce est l'un des derniers bastions du loup gris en Europe, avec une population stable dans les montagnes du nord du pays. Les montagnes abritent également des chamois, des ours bruns et des bouquetins. Sur les îles, les tortues de mer, notamment la tortue caouanne, nichent sur les plages de sable. Les eaux cristallines de la mer Égée regorgent de vie marine, avec des dauphins, des phoques moines et une variété de poissons, dont le mérou brun.
Bien que la Grèce présente des défis en matière d'environnement, elle s'efforce de préserver sa nature en mettant en place des réglementations environnementales et en protégeant les zones naturelles.