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Le Kirghizistan dispose d’une biodiversité remarquable. La grande variété de ses milieux, prairies, steppes, montagnes et désert, voit proliférer près de 7 500 plantes et plus de 12 000 espèces animales, dont 83 sont représentées par les mammifères.
La faune kirghize compte notamment le majestueux ibex de Sibérie et le renard corsac. En fonction de l’altitude, on y rencontre des marmottes, des lièvres, des loups, et plus haut, des chèvres sauvages ainsi que le léopard des neiges, plus rare et difficilement observable… Les vastes étendues du pays sont également propices à une grande variété d’oiseaux, avec notamment, en altitude, l’oie de montagnes et le pigeon bleu.
La flore du Kirghizistan est elle aussi très diversifiée, avec des plantes adaptées aux différentes altitudes et dont certaines sont exploitées pour leurs vertus médicinales. Plusieurs variétés de tulipes sont abondantes et les edelweiss ne sont pas rares.
La préservation de la biodiversité est une priorité au Kirghizistan. Le parc national de Sary-Tchelek entre autres et les 83 réserves naturelles existantes, notamment la réserve d’Ala-Archa, jouent un rôle crucial dans la préservation des espèces menacées telles que l’ibex de Sibérie et le léopard des neiges.